List of Software & Packages Installed on Vocareum

Updated:  17 September 2017

Installed Software

Software                            Version
---------------------------------- ------------
aws-cli		                     1.11.94
checkstyle	                     8.1
cmake		                     3.8.0
cuda		                     8.0.61		                     
g++		                     5.4.1
gcc		                     5.4.1
hadoop		                     2.7.1
java		                     1.8.0_131
julia		                     0.6.0
junit		                     4.12
jupyter		                     5.0.0
mesa		                     12.0.6
mysql		                     14.14
nodejs		                     4.2.6
ocaml		                     4.02.3
octave		                     4.0.0
openCL		                     2.2.8
openGL		                     4.8.7
php		                     7.0.15
python		                     2.7.12
python3		                     3.5.2
r		                     3.3.3
ros		                     indigo	
rstudio		                     1.0.136
scala		                     2.12.2
scilab		                     6.0.0
spin		                     6.4.7
ubuntu		                     16.04
valgrind		             3.11.0             

Python2 Packages

Package                            Version     
---------------------------------- ------------
alabaster                          0.7.10      
appdirs                            1.4.3       
asn1crypto                         0.22.0      
awscli                             1.11.94     
Babel                              2.4.0       
backports-abc                      0.5         
backports.shutil-get-terminal-size 1.0.0       
backports.ssl-match-hostname       3.5.0.1     
Beaker                             1.8.1       
beautifulsoup4                     4.6.0       
bkcharts                           0.2         
bleach                             2.0.0       
bokeh                              0.12.6      
boto                               2.47.0      
botocore                           1.5.57      
bz2file                            0.98        
bzr                                2.7.0       
cairocffi                          0.8.0       
CairoSVG                           1.0.22      
certifi                            2017.4.17   
cffi                               1.10.0      
chardet                            3.0.3       
Cheetah                            2.4.4       
colorama                           0.3.9       
configobj                          5.0.6       
configparser                       3.5.0       
control                            0.7.0       
coverage                           4.4.1       
cryptography                       1.9         
CVXcanon                           0.1.1       
cvxpy                              0.4.10      
cycler                             0.10.0      
Cython                             0.25.2      
decorator                          4.0.11      
DecoratorTools                     1.8         
defusedxml                         0.5.0       
dill                               0.2.6       
dnspython                          1.15.0      
docutils                           0.13.1      
dtopt                              0.1         
ecdsa                              0.13        
ecos                               2.0.4       
entrypoints                        0.2.2       
enum34                             1.1.6       
extras                             1.0.0       
fastcache                          1.0.2       
fastimport                         0.9.6       
fixtures                           3.0.0       
FormEncode                         1.3.1       
fpconst                            0.7.2       
funcsigs                           1.0.2       
functools32                        3.2.3.post2 
futures                            3.1.1       
Genshi                             0.7         
gensim                             2.1.0       
gevent                             1.2.1       
greenlet                           0.4.12      
gurobipy                           7.5.1       
gyp                                0.1         
html5lib                           0.999999999 
httplib2                           0.10.3      
httpretty                          0.8.14      
idna                               2.5         
imagesize                          0.7.1       
iniparse                           0.4         
ipaddr                             2.1.11      
ipaddress                          1.0.18      
IPy                                0.83        
ipykernel                          4.6.1       
ipython                            5.3.0       
ipython-genutils                   0.2.0       
ipywidgets                         6.0.0       
Jinja2                             2.9.6       
jmespath                           0.9.3       
jsonpatch                          1.15        
jsonpointer                        1.10        
jsonschema                         2.6.0       
jupyter-client                     5.0.1       
jupyter-core                       4.3.0       
jupyterlab                         0.22.1      
jupyterlab-launcher                0.2.9       
kitchen                            1.2.4       
ldap3                              1.0.3       
libdw                              3.1.6       
linecache2                         1.0.0       
lockfile                           0.12.2      
lxml                               3.7.3       
M2Crypto                           0.26.0      
Mako                               1.0.6       
Markdown                           2.6.8       
MarkupSafe                         1.0         
matplotlib                         2.0.2       
mercurial                          4.2         
MiniMock                           1.2.8       
mistune                            0.7.4       
mock                               2.0.0       
mpmath                             0.19        
multiprocess                       0.70.5      
MySQL-python                       1.2.5       
mysqlclient                        1.3.7       
nbconvert                          5.2.1       
nbformat                           4.3.0       
networkx                           1.11        
nltk                               3.2.4       
nose                               1.3.7       
nose-exclude                       0.5.0       
notebook                           5.0.0       
numpy                              1.12.1      
oauth2                             1.9.0.post1 
olefile                            0.44        
packaging                          16.8        
pandas                             0.20.1      
pandocfilters                      1.4.1       
paramiko                           2.1.2       
Paste                              2.0.3       
PasteDeploy                        1.5.2       
PasteScript                        2.0.2       
pathlib2                           2.2.1       
pbr                                3.0.1       
pep8                               1.7.0       
pexpect                            4.2.1       
pickleshare                        0.7.4       
Pillow                             4.1.1       
pip                                9.0.1       
plotly                             2.0.14      
ply                                3.10        
prettytable                        0.7.2       
prompt-toolkit                     1.0.14      
protobuf                           3.3.0       
psycopg2                           2.7.1       
ptyprocess                         0.5.1       
py                                 1.4.33      
pyasn1                             0.2.3       
pyasn1-modules                     0.0.8       
pycparser                          2.17        
pycrypto                           2.6.1       
pycurl                             7.43.0      
pyenchant                          1.6.6       
Pygments                           2.2.0       
pygpgme                            0.3         
pyinotify                          0.9.6       
pyliblzma                          0.5.3       
pyOpenSSL                          17.0.0      
pyparsing                          2.2.0       
pystache                           0.5.4       
pytest                             3.1.1       
python-crfsuite                    0.9.2       
python-daemon                      2.1.2       
python-dateutil                    2.6.0       
python-ldap                        2.4.22      
python-lzo                         1.8         
python-memcached                   1.58        
python-mimeparse                   1.6.0       
pytz                               2017.2      
pyudev                             0.21.0      
pyxattr                            0.5.3       
PyYAML                             3.12        
pyzmq                              16.0.2      
requests                           2.17.3      
rsa                                3.4.2       
s3transfer                         0.1.10      
scandir                            1.5         
scikit-learn                       0.18.1      
scipy                              0.19.0      
scour                              0.32        
scs                                1.2.6       
seaborn                            0.7.1       
selenium                           3.4.3       
setuptools                         35.0.2      
simplegeneric                      0.8.1       
simplejson                         3.10.0      
singledispatch                     3.4.0.3     
six                                1.10.0      
slycot                             0.2.0       
smart-open                         1.5.3       
snowballstemmer                    1.2.1       
SOAPpy                             0.12.22     
Sphinx                             1.6.2       
sphinxcontrib-websupport           1.0.1       
SQLAlchemy                         1.1.0b3     
subprocess32                       3.2.7       
sure                               1.4.6       
sympy                              1.0         
Tempita                            0.5.2       
tensorflow                         1.1.0       
terminado                          0.6         
testpath                           0.3.1       
testtools                          2.3.0       
tflearn                            0.3.1       
toolz                              0.8.2       
torch                              0.1.12.post2
torchvision                        0.1.8       
tornado                            4.5.1       
traceback2                         1.4.0       
traitlets                          4.3.2       
typing                             3.6.1       
unittest2                          1.1.0       
urlgrabber                         3.10.2      
urllib3                            1.21.1      
virtualenv                         15.1.0      
waitress                           1.0.2       
wcwidth                            0.1.7       
webencodings                       0.5.1       
WebOb                              1.7.2       
WebTest                            2.0.27      
Werkzeug                           0.12.2      
wheel                              0.29.0      
widgetsnbextension                 2.0.0       
WSGIProxy                          0.2.2       
wstools                            0.4.5       
zope.interface                     4.4.1       

Python3 Packages

Package                            Version     
---------------------------------- ------------
alembic                            0.9.2       
apparmor                           2.10.95     
appdirs                            1.4.3       
asn1crypto                         0.22.0      
backports-abc                      0.5         
backports.shutil-get-terminal-size 1.0.0       
beautifulsoup4                     4.6.0       
bkcharts                           0.2         
bleach                             2.0.0       
blinker                            1.4         
bokeh                              0.12.6      
boto                               2.47.0      
bz2file                            0.98        
certifi                            2017.4.17   
cffi                               1.10.0      
chardet                            3.0.3       
cloud-init                         0.7.9       
command-not-found                  0.3         
configobj                          5.0.6       
control                            0.7.0       
cryptography                       1.9         
CVXcanon                           0.1.1       
cvxpy                              0.4.10      
cycler                             0.10.0      
decorator                          4.0.11      
dill                               0.2.6       
ecos                               2.0.4       
entrypoints                        0.2.2       
fastcache                          1.0.2       
gensim                             2.1.0       
html5lib                           0.999999999 
idna                               2.5         
ipykernel                          4.6.1       
ipython                            6.0.0       
ipython-genutils                   0.2.0       
ipywidgets                         6.0.0       
jedi                               0.10.2      
Jinja2                             2.9.6       
jsonpatch                          1.15        
jsonpointer                        1.10        
jsonschema                         2.6.0       
jupyter                            1.0.0       
jupyter-client                     5.0.1       
jupyter-console                    5.1.0       
jupyter-core                       4.3.0       
jupyterhub                         0.7.2       
jupyterhub-dummyauthenticator      0.3.1       
jupyterhub-simplespawner           0.1         
jupyterlab                         0.22.1      
jupyterlab-launcher                0.2.9       
language-selector                  0.1         
ldap3                              1.0.3       
LibAppArmor                        2.10.95     
libdw                              3.1.6       
lxml                               3.7.3       
Mako                               1.0.6       
MarkupSafe                         1.0         
matplotlib                         2.0.2       
metakernel                         0.20.3      
mistune                            0.7.4       
mpmath                             0.19        
multiprocess                       0.70.5      
mysql-connector-python             2.1.3       
nbconvert                          5.2.1       
nbformat                           4.3.0       
networkx                           1.11        
nltk                               3.2.4       
nose                               1.3.7       
notebook                           5.0.0       
numpy                              1.12.1      
oauthlib                           2.0.2       
octave-kernel                      0.26.2      
olefile                            0.44        
packaging                          16.8        
pamela                             0.3.0       
pandas                             0.20.1      
pandocfilters                      1.4.1       
pexpect                            4.2.1       
pickleshare                        0.7.4       
Pillow                             4.1.1       
pip                                9.0.1       
plotly                             2.0.14      
ply                                3.10        
prettytable                        0.7.2       
prompt-toolkit                     1.0.14      
protobuf                           3.3.0       
psutil                             5.2.2       
ptyprocess                         0.5.1       
pyasn1                             0.2.3       
pycparser                          2.17        
pycurl                             7.43.0      
pyenchant                          1.6.6       
Pygments                           2.2.0       
pygobject                          3.20.0      
pygpgme                            0.3         
PyJWT                              1.5.0       
pyparsing                          2.2.0       
pyserial                           3.3         
python-apt                         1.1.0b1     
python-crfsuite                    0.9.2       
python-dateutil                    2.6.0       
python-debian                      0.1.28      
python-editor                      1.0.3       
python-http-client                 2.2.1       
python-systemd                     231         
pytz                               2017.2      
pyxattr                            0.5.3       
PyYAML                             3.12        
pyzmq                              16.0.2      
qtconsole                          4.3.0       
requests                           2.17.3      
scikit-learn                       0.18.1      
scipy                              0.19.0      
scs                                1.2.6       
seaborn                            0.7.1       
selenium                           3.4.3       
sendgrid                           4.1.0       
setuptools                         35.0.2      
simplegeneric                      0.8.1       
six                                1.10.0      
slycot                             0.2.0       
smart-open                         1.5.3       
SQLAlchemy                         1.1.10      
ssh-import-id                      5.6         
sympy                              1.0         
tensorflow                         1.1.0       
terminado                          0.6         
testpath                           0.3.1       
tflearn                            0.3.1       
toolz                              0.8.2       
torch                              0.1.12.post2
torchvision                        0.1.8       
tornado                            4.5.1       
traitlets                          4.3.2       
ufw                                0.35        
unattended-upgrades                0.1         
urllib3                            1.21.1      
virtualenv                         15.1.0      
wcwidth                            0.1.7       
webencodings                       0.5.1       
Werkzeug                           0.12.2      
wheel                              0.29.0      
widgetsnbextension                 2.0.0       

R Packages

Package              Version     
-------------------- ------------
AlgDesign            1.1-7.3    
assertthat           0.2.0      
backports            1.0.5      
base                 3.3.3     
base64enc            0.1-3      
BH                   1.62.0-1   
bindr                0.1        
bindrcpp             0.2        
bit                  1.1-12     
bit64                0.9-7      
bitops               1.0-6      
blob                 1.1.0      
boot                 1.3-18     
brew                 1.0-6      
broom                0.4.2      
callr                2.0.2      
car                  2.1-4      
caret                6.0-76     
caTools              1.17.1     
cellranger           1.1.0      
chemometrics         1.4.2      
class                7.3-14     
cli                  1.0.0      
cluster              2.0.5      
codetools            0.2-15     
coin                 1.1-3      
colorspace           1.3-2      
compiler             3.3.3      
corrgram             1.12       
crayon               1.3.4      
curl                 2.6        
cvTools              0.3.2      
datasets             3.3.3     
data.table           1.10.4-3   
data.tree            0.7.0      
DBI                  0.7        
dbplyr               1.2.1      
debugme              1.1.0      
dendextend           1.7.0      
DEoptimR             1.0-8      
devtools             1.13.2     
DiagrammeR           0.9.0      
dichromat            2.0-0      
digest               0.6.12     
diptest              0.75-7     
doParallel           1.0.10     
dplyr                0.7.4      
DT                   0.2       
e1071                1.6-8     
evaluate             0.10    
fivethirtyeight      0.2.0    
flexmix              2.3-14     
forcats              0.2.0      
foreach              1.4.3      
foreign              0.8-67     
formatR              1.5        
fpc                  2.1-11     
fueleconomy          0.1        
gclus                1.3.1      
gdata                2.18.0     
GGally               1.3.2      
ggplot2              2.2.1      
git2r                0.18.0     
glue                 1.2.0      
Gmedian              1.2.3      
GPArotation          2014.11-1  
gplots               3.0.1      
graphics             3.3.3      
grDevices            3.3.3      
grid                 3.3.3      
gridBase             0.4-7      
gridExtra            2.2.1      
gtable               0.2.0      
gtools               3.5.0      
gurobi               7.5-1      
haven                1.1.1      
highr                0.6        
HistData             0.8-2      
hms                  0.3        
htmltools            0.3.6      
htmlwidgets          0.8        
httpuv               1.3.3      
httr                 1.3.1      
igraph               1.0.1      
import               1.1.0      
influenceR           0.1.0      
IRdisplay            0.4.4      
IRkernel             0.8.6.9000 
irlba                2.2.1      
iterators            1.0.8      
jsonlite             1.5        
kernlab              0.9-25     
KernSmooth           2.23-15    
knitr                1.16       
labeling             0.3        
laeken               0.4.6      
Lahman               5.0-0      
lars                 1.2        
lattice              0.20-34    
lazyeval             0.2.0      
lme4                 1.1-13     
lmtest               0.9-35     
lpSolve              5.6.13     
lpSolveAPI           5.5.2.0-17 
lubridate            1.7.2      
magrittr             1.5        
maps                 3.2.0      
markdown             0.8       
MASS                 7.3-45     
Matrix               1.2-8      
MatrixModels         0.4-1      
mclust               5.4        
memoise              1.1.0      
methods              3.3.3      
mgcv                 1.8-17     
mime                 0.5       
minqa                1.2.4      
mnormt               1.5-5      
ModelMetrics         1.1.0      
modelr               0.1.1      
modeltools           0.2-21     
multcomp             1.4-6      
munsell              0.4.3      
mvoutlier            2.0.9      
mvtnorm              1.0-6      
NeuralNetTools       1.5.0      
nlme                 3.1-131    
nloptr               1.0.4      
NMF                  0.20.6     
nnet                 7.3-12     
nycflights13         0.2.2      
odbc                 1.1.5      
openssl              0.9.6      
packrat              0.4.8-1    
parallel             3.3.3      
party                1.2-3      
pbdZMQ               0.2-6      
pbkrtest             0.4-7      
pcaPP                1.9-73     
pillar               1.1.0      
pkgconfig            2.0.1      
pkgmaker             0.22       
PKI                  0.1-3     
plogr                0.1-1      
pls                  2.6-0      
plyr                 1.8.4      
polycor              0.7-9      
prabclus             2.2-6      
praise               1.0.0      
prettyunits          1.0.2      
progress             1.1.2      
pryr                 0.1.2      
psych                1.7.5      
purrr                0.2.4      
qap                  0.1-1      
quadprog             1.5-5      
quantreg             5.33       
R6                   2.2.2      
radiant              0.8.0      
radiant.basics       0.8.0      
radiant.data         0.8.1      
radiant.design       0.8.0      
radiant.model        0.8.0      
radiant.multivariate 0.8.0      
RColorBrewer         1.1-2      
Rcpp                 0.12.15    
RcppArmadillo        0.7.800.2.0
RcppEigen            0.3.3.3.0  
RCurl                1.95-4.8   
readr                1.1.1      
readxl               1.0.0      
registry             0.3        
rematch              1.0.1      
repr                 0.12.0     
reprex               0.1.2      
reshape              0.8.7    
reshape2             1.4.2     
rgexf                0.15.3     
RJSONIO              1.3-0      
rlang                0.2.0      
rmarkdown            1.5        
rngtools             1.2.4      
robCompositions      2.0.6      
robustbase           0.92-7     
Rook                 1.1-1      
rpart                4.1-10     
rprojroot            1.2        
rrcov                1.4-3      
rsconnect            0.8        
Rsolnp               1.16       
RSpectra             0.12-0     
rstudioapi           0.7        
rvest                0.3.2      
sandwich             2.3-4      
scales               0.4.1      
selectr              0.3-1      
seriation            1.2-3      
sgeostat             1.0-27     
shiny                1.0.3      
shinyAce             0.2.1      
slam                 0.1-40     
som                  0.3-5.1    
sourcetools          0.1.6      
sp                   1.2-7      
SparseM              1.77       
spatial              7.3-11     
splines              3.3.3      
sROC                 0.1-2      
stats                3.3.3      
stats4               3.3.3      
stringi              1.1.5      
stringr              1.2.0      
strucchange          1.5-1      
survival             2.40-1     
tcltk                3.3.3      
testthat             2.0.0      
TH.data              1.0-8      
tibble               1.4.2      
tidyr                0.8.0      
tidyselect           0.2.3      
tidyverse            1.2.1      
tools                3.3.3      
trimcluster          0.1-2      
truncnorm            1.0-7      
TSP                  1.1-5      
utf8                 1.1.3      
utils                3.3.3      
uuid                 0.1-2      
vcd                  1.4-4      
VIM                  4.7.0      
viridis              0.4.0      
viridisLite          0.2.0      
visNetwork           1.0.3      
whisker              0.3-2      
withr                2.1.1      
wordcloud            2.5        
XML                  3.98-1.7   
xml2                 1.1.1      
xtable               1.8-2      
yaml                 2.1.14    
zoo                  1.8-0